Molegro Virtual Docker - интегрированный программный пакет для предсказания взаимодействий типа протеин-лиганд при моделировании белковых структур. Он охватывает все аспекты процесса молекулярной сборки – от создания молекул протеинов до определения в них потенциальных центров, с которыми связываются лиганды, и, кроме того, прогнозирует характер этих связей. Molegro Virtual Docker предоставляет пользователю набор современных высококлассных инструментов для осуществления подобной сборки, которая базируется на новом, более эффективном методе оптимизации структуры, органично сочетаясь с удобным интефейсом, что обеспечивает высокую производительность и надежность данного ПО. При сравнительном тестировании аналогичных программ, созданных другими компаниями, MVD показал наиболее высокую точность (docking accuracy) в предсказании процесса молекулярного синтеза белков: MVD – 87%, Glide – 82%, Surflex – 75%, FlexX – 58%.
Molegro Data Modeller is a cross-platform application for data mining, data modelling, and data visualization. Create regression and classification models using partial least squares, neural networks, multiple linear regression, or support vector machines. Models are saved together with relevant normalization information making them easy to apply to new datasets. Cross-validation and feature selection can be applied using the built-in wizards. Automatic search for optimal model parameter settings.
Molegro Data Modeller Overview
- Data preparation: repair missing values, outlier detection, principal component analysis
- Data modelling: regression, classification, and clustering
- Chemistry: molecule depictions and SMILES/SDF support
- Data transformations
- Data visualization: histograms, 2D/3D plots, project multidimensional data onto 2D/3D
- Support for KNIME integration